primer5

primer5正式版是一款由Premier公司推出的引物设计软件。primer5官方版内置了酶切分析窗口、纹基分析窗口、引物设计窗口、序列编辑窗口，给专业人员带来了极大的便利。通过primer5软件用户可以进行PCR、测序引物、杂交探针的设计操作，功能更加强大。

软件功能

1、种间交叉引物设计

利用来自多个物种的序列设计扩增引物

2、病理检测引物设计

可以用在高保区域设计引物

3、等位基因特效引物

设计专用于扩增某一类相关序列中特定成员的引物

4、软件的主要功能分四种

即引物设计、限制性内切酶位点分析、dna 基元(motif)查找和同源性分析功能。前三种为其主要功能。此外，该软件还有一些特殊功能，其中最重要的是设计简并引物，另外还有序列朗读、dna 与蛋白序列的互换、语音提示键盘输入等等。

5、还可以针对模板dna 的来源以相应的遗传密码规则转换dna 和氨基酸序列。

软件共给出八种生物亚结构的不同遗传密码规则供用户选择，有纤毛虫大核(ciliate macronuclear)、无脊椎动物线粒体(invertebrate mitochondrion)、支原体(mycoplasma)、植物线粒体(plant mitochondrion)、原生动物线粒体(protozoan mitochondrion)、一般标准(standard)、脊椎动物线粒体(vertebrate mito-chondrion)和酵母线粒体(yeast mitochondrion)。

软件特色

1、给专业人员带来的极大的便利，另外小编为大家带来的这款最新版本功能更加强大，立足点也是按照引物设计的基本原则，只是更加快速和自动化而已

2、是款用软件设计引物软件，该软件分为四大块，尤其常用的是引物设计、限制性内切酶位点分析和DNA 基元(motif)查找

3、我们可以直接提交模板序列到特定网页，如著名的primer3，得到设计好的引物，也可以在本地计算机上运行引物设计专业软件

4、主要界面是分为GeneTank(序列编辑)、Primer(引物设计)、Aling(序列比较)、Enzyme(酶切分析)和Mitif(基序分析)。

5、该软件就是用来进行引物设计的

6、可以简单地通过手动拖动鼠标以扩增出相应片段所需的引物

7、在手动的任何时候，下面显示各种参数的改变和可能的二聚体、异 二聚体、发夹结构等，也可以给定条件，让软件自动搜索引物，并将引物分析结果显示出来

8、使用Primer Premier，操作非常简单

使用教程

1、进入软件之后，主界面如下图所示;

2、点击下雨红框里面的Primer出现下图界面;

3、点击下图红框里面的Search出现下图界面，设置好了之后，点击OK;

4、点击Align出现下图界面，可以进行快速的转换，点击OK即可转换。

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